Я там aide предлагал, почему бы не использовать его и тут?
Хотя, я топлю за PBS, он и проверять архивы умеет и дедуплицирукт и правила очистки
Можно монтировать бэкапы в фс, а потом просто скопировать нужный файл. Единственное чего не нашел полноценно, так это сравненя бэкапов между собой на предмет показа списка изученных файлов.